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上集退休被洗去記憶的特警K(湯美李鍾斯)於今集擔任郵局局長，對MIB全無記憶。他的舊拍檔J(韋 史密夫)成為最優秀特警，在調查一宗外星人案件時，揭發外星人侵襲地球大陰謀。能夠阻止這場浩劫的只有K，故此J設法令K恢復記憶。事件又涉及一名曾目睹外星人的Laura(羅莎莉奧·多遜)，但J寧願違反MIB守則也不肯向她洗腦。且看J與K能否有力對抗入侵地球的外星力量．．．...

梅森·史多姆調查貪腐政客，卻遭到槍擊，還被棄置不管。在一位護理師的照料下，他恢復健康，並著手復仇。...

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